甘肃秦州珍稀水生野生动物国家级自然保护区位于天水市秦州区娘娘坝镇境内的白家河流域和藉河流域的藉口镇、关子镇及杨家寺镇境内，由长江流域嘉陵江的支流白家河的大鲵片区和黄河流域渭河支流藉河的秦岭细鳞鲑片区组成。保护区总面积3010公顷，范围在东经 105°12′19″－105°59′48″，北纬 34°05′42″－34°37′03″之间。主要保护对象为大鲵和秦岭细鳞鲑。根据保护对象分布区域不同，保护区分为大鲵片区和秦岭细鳞鲑片区，其中：大鲵片区位于秦州区东南部娘娘坝镇境内，范围包括白家河流域的望天河、庙川河、北峪河、花园河、响潭河、螃蟹河6条一级支流14条二级支流的水面以及河流两岸向外延伸52米的区域，面积1372 公顷，属于长江流域嘉陵江水系。白家河流域最低海拔1464m，最高海拔2128m，平均海拔高度1770m。秦岭细鳞鲑片区位于秦州区西北部的藉口镇、关子镇和杨家寺镇3镇境内，范围包括藉河流域的金家河和潘家河2条一级支流14条二级支流的水面以及河流两岸向外延伸52米的区域，面积1638 公顷，属于黄河流域藉河水系。藉河流域最低海拔1626m，最高海拔2600m，平均海拔高度2100m。

甘肃秦州珍稀水生野生动物国家级自然保护区横跨长江、黄河两大流域。属大陆性暖温带半湿润气候类型。冬季多西北风，气候干燥寒冷，夏季多东南风，气流暖湿，春秋两季为冬夏过渡季节，四季分明。有较为丰富的光、热、水资源，适宜多种动植物生长，孕育了过渡带内丰富的生物资源。白家河和藉河上游山溪沟壑纵横，山泉伏流密布，溪河两岸植被完整，乔灌丛生，环境阴凉，生态环境基本处于自然状态，动植物资源丰富，是国家Ⅱ级保护野生动物大鲵和秦岭细鳞鲑理想栖息地，也是秦岭北坡大鲵和我国所特有陆封型冷水鱼类秦岭细鳞鲑在高海拔区域分布的特殊区域。